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个人公众号开通啦

发表于 2022-04-18 | 分类于 生活
个人微信公众号开通啦2022年4月16日,个人微信公众号 “flatig的开发日记” 正式开通啦!欢迎各位朋友前来关注!!!
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如果你忘记我

发表于 2022-03-14 | 分类于 诗歌
英语兔朗读 诺贝尔文学奖得主经典情诗《如果你忘记我》(聂鲁达) If You Forget Meby Pablo Neruda I want you to know one thingYou know how this is: If I lookat the crystal moon, at the ...
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使用HISAT StringTie和Ballgown进行的转录本表达水平分析(中译)(四)

发表于 2022-03-12 | 分类于 生物信息学习
流程将RNA-seq reads与基因组进行比对 ● 时间<20分钟 将每个样本的reads映射到参考基因组上 123456789101112131415161718192021222324252627282930313233343536$ hisat2 -p 8 --dta -x chrX ...
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使用HISAT StringTie和Ballgown进行的转录本表达水平分析(中译)(三)

发表于 2022-03-12 | 分类于 生物信息学习
材料配置 数据(本方案中使用的RNA-seq reads、索引和基因注释的例子可在链接;详情见设备设置) HISAT2软件(链接1或链接2),2.0.1或更高版本 StringTie软件(链接1或链接2, 1.2.2 或更高版本) SAMtools (链接, 版本0.1.19或更高) R(链接,版 ...
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使用HISAT StringTie和Ballgown进行的转录本表达水平分析(中译)(二)

发表于 2022-03-09 | 分类于 生物信息学习
实验设计用HISAT进行reads比对RNA-seq分析开始时,将reads与参考基因组进行映射,以确定其基因组位置。这种映射信息使我们能够收集每个基因对应的reads子集,然后进行组装,并对这些reads所代表的转录本进行量化。已经开发了几种将reads与基因组对齐的快速算法,其中Bowtie和B ...
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使用HISAT StringTie和Ballgown进行的转录本表达水平分析(中译)(一)

发表于 2022-03-08 | 分类于 生物信息学习
12本文章基于 DeepL 进行初步翻译,后人工调整部分语法和句式以使其通顺易读。具有相应基础知识的读者可以阅读此篇文章以横向扩充知识: RNA-seq数据分析—方法学文章的实战练习 作者: Mihaela Pertea1,2, Daehwan Kim1, Geo M Pertea1, Jeffre ...
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你好啊,世界

发表于 2022-02-27 | 分类于 生活
我们开始吧! “I’m sick of those heroes in the sky to teach us how to fly”–《We Cry》 flatig,这个名字起源于一个很多年前的故事。那时,有一些不知天高地厚的小子妄想改变这个世界,他们聚在一起,想了几个简单的单词拼起来。 Fut ...
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